当法院对一辆车进行查封并要求车主上交时，如果车主拒绝配合或违反了相关规定，将面临一系列的后果和处罚。

首先，法院有权采取强制措施。法院会通知执行法官前往现场，并可以通过强制拖车将车辆运送到指定地点。这不仅会给车主带来麻烦和不便，还可能造成车辆的损坏或其他问题。

其次，车主将面临行政处罚。依据相关法律法规，拒不按法院要求上交被查封车辆的车主可以被处以罚款、行政拘留等行政处罚。这些处罚将对车主的经济和个人自由带来直接影响。

此外，法院还可以向公安机关发出通报，将车主列入不信任名单。这意味着车主在日常生活中将面临诸如限制乘坐高铁、飞机等交通工具的禁令，甚至可能对社会信用产生长期的负面影响。

最重要的是，车主未按法院要求上交被查封车辆可能会被视为妨碍诉讼。这将对车主的信用记录和声誉产生不利影响，并可能面临更严厉的法律后果。

总之，法院查封车辆是一项正当的行为，车主有义务按照法院要求进行配合。如果车主拒绝上交被查封车辆，将会面临强制措施、行政处罚、限制乘坐公共交通工具等一系列后果，同时也可能对个人信用带来长期负面影响。