法院冻结存款是指司法机关在特定情况下依法对个人或组织的存款进行冻结措施，以确保执行程序正常进行。然而，当冻结存款造成损失时，受影响的个人或组织有权向法院申请赔偿。

首先，个人或组织应及时向法院提出赔偿申请。冻结存款损失发生后，应保留相关凭证等证据作为赔偿申请的依据。通过书面方式向执行法院递交申请，详细描述冻结损失的事实和金额。

接着，法院将对赔偿申请进行审理。执行法官会根据申请人提供的证据和理由，判断是否符合相关法律规定，并进行相应评估。例如，判断冻结是否属于非法行为、是否存在过错等情况。

在判决中，法院会确定何种方式进行赔偿。一般而言，法院可以采取从未冻结资产中赔偿、责令对方支付赔偿金、解除冻结等具体措施。具体赔偿方式取决于具体案情和法律规定。

同时，申请人也应尊重法院的判决结果。一旦法院作出赔偿判决，申请人应配合执行程序，履行相应的手续并接受执行。故意逃避或拒不执行法院判决，可能会引起更严重的后果。

最后，建议个人或组织在面临冻结存款的情况下寻求专业法律援助。律师会根据具体案件的情况，协助制定有效的赔偿申请策略，并提供具体的法律意见和指导。

总之，在法院冻结存款造成损失的情况下，个人或组织有权向法院申请赔偿。通过正当的申请和依法的审理程序，冻结存款的受影响方可以获得合理的赔偿。