在购房过程中，一些人选择自建房作为居住的方式。然而，一些朋友关心的问题是，如果自建房没有合法的房产证，会不会被法院查封呢？

首先，需要明确的是，根据我国《物权法》的规定，只有获得了房产证的房屋才能被视为合法所有权。所以，如果你的自建房没有办理房产证手续，那么它并没有合法的房屋所有权。

其次，根据我国法律的规定，对于没有合法所有权的房屋，法院是有权进行查封的。查封是指法院根据法律程序，限制房屋的处置权和使用权，以保护债权人的利益。这就意味着，如果你的自建房没有合法的房产证，面临着被法院查封的风险。

但是，实际情况可能会因地区、性质等各种因素而有所不同。在一些较为偏远的地区或者乡村地区，对自建房缺乏监管，可能存在较小的被查封风险。然而，在城市或者发达地区，房屋监管相对严格，自建房被查封的可能性较大。

最后，希望大家明确一点，自建房没有合法的房产证始终存在潜在的风险，同时也造成了一些不便。因此，我建议大家在购房时，还是选择具备合法手续和完备权益保障的新房、二手房等有房产证的房屋，这样更能保证自己的权益不受侵害。