土地使用证是指国家授予个人、团体或单位合法占用并使用土地的证明文件。它具有确权、确定权属和保护权益的作用，是土地所有权和使用权的法律依据。

然而，虽然土地使用证是合法的土地利用凭证，但在特定条件下，法院是有权对其进行查封的。

首先，土地使用证会被法院查封的情况之一是涉及土地纠纷。纠纷可能出现在土地权属、土地界线、土地使用权等方面。当相关当事人发生土地纠纷时，可以申请法院对土地使用证进行查封，以保护各参与方的合法权益。

其次，土地使用证也可能因违法用地行为而被法院查封。例如，在未经批准的情况下违规占用、挪用土地，或者将土地用于非法目的。这些行为属于违法用地行为，法院有权依法对其进行查封，以制止违法行为。

此外，土地使用证还可能因其他法律规定的情况而被法院查封。例如，当土地涉及刑事犯罪案件、涉及国家安全等特殊情况时，法院可以对土地使用证进行查封。

总之，虽然土地使用证是合法的土地利用凭证，但在特定条件下，法院是有权对其进行查封的。这是为了保护土地纠纷当事人的权益，以及制止违法用地行为。因此，土地使用证持有人应严格依法使用土地，避免触犯法律，在确保自身权益的同时，也维护了社会秩序和公共利益。