法院查封车辆和扣押是两种不同的法律行为，其目的和效果有所区别。

首先，查封车辆是指法院依法对被告的车辆进行封存，禁止其买卖、变卖或者其他转让行为。在查封期间，被封车辆的权益仍属于原车主，只是不能进行交易。这个措施的目的是为了保证法院判决生效后能够执行，防止被告在判决生效前将车辆变卖或转移，从而保障执行的效力。查封车辆一般是针对被告车辆进行的，以保障债权人的利益。

其次，扣押车辆是指警方或法院依照法律规定，对涉嫌违法的车辆进行强制措施，并将车辆暂时扣留在特定地点。扣押车辆一般是在调查取证、追缴赃物或处罚违法行为等情况下进行的。与查封车辆不同的是，被扣押的车辆的权益在一定程度上已经被剥夺，车辆属于被国家机关实际控制。

查封车辆和扣押车辆在法律效果上也有所区别。查封车辆是为了保障债权人的利益，在查封期间，被封车辆的转让、租赁或转借等行为都将被认定为无效。一旦执行到位，法院会依法进行拍卖或变卖，将车辆变现以获取债权人应得的利益。而扣押车辆则是根据刑事诉讼法等相关法律进行的行政强制措施，经过司法程序后，由国家机关依法处理，可能根据案件性质进行追缴、拍卖等处置程序。

总体来说，法院查封车辆和扣押车辆是两种不同的法律行为，其目的和效果有所区别。查封车辆是为了保障债权人的利益，在执行期间限制被告对车辆的处置权；扣押车辆则是为了配合刑事诉讼、追缴赃物等行为，经过司法程序后由国家机关依法处置。对于涉及车辆的法律纠纷，各方应当根据具体情况选择合适的法律手段和途径，以维护自身的合法权益。