法院冻结是司法机关对被执行人的财产采取强制措施，以确保执行权利人的利益。在一起案件中，如果法院判决了对被执行人的财产进行冻结，那么该笔资金将被冻结并不可动用。然而，一旦被执行人的金额入账后，法院必须对冻结的资金进行处理。

首先，在冻结金额入账后，法院会与执行权利人进行核实，确保入账金额与冻结金额一致。如果一致，法院将根据相关法律规定和执行程序，按照执行权利人的申请进行资金划拨。划拨后的资金将直接进入执行权利人的账户，用于满足其对被执行人的债务要求。

然而，并非所有情况下冻结金额都会全部划拨给执行权利人。如果被执行人存在多笔债务，法院可能会根据债权顺序，依次将冻结金额划拨给各个债权人，直至债务得到偿还或者冻结金额耗尽。

此外，在一些特殊情况下，冻结金额也可能被法院暂时扣押。例如，在诉讼过程中，如被执行人提出异议，法院需要进行裁决，并决定是否解除资金冻结。在这种情况下，法院可能会暂时扣押冻结金额，以确保案件的正常进行。

总而言之，法院对被执行人的财产进行冻结后，当冻结金额入账时，法院会根据执行权利人的申请和相关法律规定，进行划拨或暂扣。通过这一系列严格的程序，确保执行权利人的利益得到维护，同时也保障了被执行人在诉讼中的合法权益。