棉花补贴款是指政府向农民发放的一种资金补贴，旨在支持和保护农业产业。然而，在实际操作过程中，存在一些问题。其中一个问题是，如果农民未按照相关规定使用或核实了补贴款项，法院是否有权利将其查封。

首先，我们需要明确的是，棉花补贴款是属于农业补贴范畴内的经济利益。根据我国《中华人民共和国行政诉讼法》第13条规定，实施行政补贴的机关在保障权利追索进程中享有查封权。这意味着，法院可以对未按规定使用或核实补贴款项的申请人采取查封措施。

其次，是否查封棉花补贴款还需综合考虑其他相关因素。例如，补贴款是通过哪个部门发放的？该部门之前是否有过查封补贴款的先例？以及是否存在严重违规行为等。这些因素都将直接影响法院是否会对补贴款进行查封。

同时，查封补贴款也要符合一定的法律程序。法院在查封补贴款之前，应当向申请人发出合法的通知，并给予其相应的答复时间。此外，法院还需对查封申请进行专门审查和调查，确保具备充分的证据和依据，以保证查封决定的合法性和公正性。

然而，虽然法院有权利查封棉花补贴款，但这并不意味着一定会采取查封措施。实际上，在解决类似纠纷时，法院更倾向于采取其他方式，如要求返还或重新补贴等，以保障双方的合法权益。

总结来说，棉花补贴款的查封问题需要综合考虑相关规定和具体情况，同时法院也应遵循法律程序，确保查封行为符合法律规定。另外，可以通过加强管理和监管机制，加大对补贴款使用情况的审查力度来减少类似纠纷的发生。