法院在执行程序中有权根据法律规定对违法者的财产采取查封措施，以保障正当权益和执行效果。然而，是否能够查封国家机关的财产却是一个备受争议的话题。

首先，根据我国《行政诉讼法》规定，法院在受理行政案件时可以对行为人的财产采取查封措施，但有关国家机关的财产是否适用此项规定则需要审慎考虑。因为国家机关的财产通常涉及公共利益和公共事务的处理，一旦被查封可能会对国家机关的正常运转产生不利影响。

其次，根据我国《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，在刑事案件中，法院可以对被告人的财产采取查封措施。但是，对于国家机关的财产，法院在执行过程中也要进行合理的考量。如果查封国家机关的财产会导致国家机关无法正常履行职责，就需要谨慎决策。

再者，在某些特殊情况下，法院也可能会根据法律规定对国家机关的财产采取查封措施。比如，在涉及刑事犯罪或严重违法行为的国家机关工作人员个人财产中，如果存在来路不明、证据不足等情况，法院有权利对其进行查封，以确保司法程序的公正和合理性。

综上所述，是否能够查封国家机关的财产是一个需要严肃对待的问题。法院在执行过程中应该综合考虑国家机关的特殊性、公共利益和正当权益，并依据相关法律法规进行相应的操作。关键是要平衡各方面的利益，既要保障社会公众的权益，也要尊重并确保国家机关的正常运转。这样才能保持司法公正和社会稳定的良好发展态势。