法院能不能冻结党费专户？这是一个备受争议的问题。关于此问题，需要分析相关法律法规，并从不同角度进行思考。

首先，党费专户在我国党建工作中扮演着重要角色。根据相关法律规定，党费专户用于支持党组织和党员日常活动、党内民主生活会、党员培训以及党风廉政建设等方面开支。因此，对党费专户应给予一定保护，以确保党组织正常运转。

然而，法院作为司法机关，有权对涉案财产进行冻结，以保障诉讼程序的进行并防止被告逃避执行。从法律角度来看，法院是可以冻结党费专户的。但是必须强调的是，冻结党费专户必须符合法定条件，且在一定程度上尊重党组织的意见。

在处理党费专户冻结案件时，法院应该慎重决策，并采取措施确保党费专户的资金不被滥用或损失。法院可以要求党组织提供党费专户资金用途清单，以确保党费专户的款项使用合法合规。

此外，应该注意到，党费专户的冻结并不意味着党组织将无法开展正常活动。党费专户只是党组织的一个资金管理工具，冻结党费专户不等于对整个党组织进行封堵。在确保案件程序正当性和公平性的前提下，可以在一定范围内适度减少党费支出，以避免对党组织正常运转造成过大影响。

最后需要指出的是，党费专户的冻结在实践中存在一定的难度。例如，对于党费专户资金的流动性处理以及冻结时间的确定等问题都需要综合考虑各个方面的利益，并寻求合理的解决办法。

综上所述，法院在特定条件下可以冻结党费专户。但是，必须以符合法律规定、尊重党组织意见为原则，并采取相应措施保障党费专户的合法合规使用。同时，冻结党费专户也需要综合考虑党组织正常运行的需要，以确保党建工作的顺利开展。