股权质押是一种常见的融资手段，在企业发展和个人投资中广泛应用。但是，债务人在进行股权质押后，如果不能按时偿还债务，可能引发一系列法律问题。其中一个重要问题是，如果债权人起诉债务人，法院能否冻结被质押的股权？

首先，我们需要了解什么是股权质押。股权质押是指股东将其持有的股权作为担保物，向贷款人申请获得贷款。一旦债务人无法履行合同义务，债权人可以依法处置质押的股权，以保障债权人的利益。

然而，尽管债权人取得了股权的控制权，法院并不能直接对被质押的股权进行冻结。根据我国《公司法》第四十七条的规定，股权质押是一种合法的行为，质权人有权处置质押股权。法院不会干预合法的权益转让。

然而，即使法院不能直接冻结被质押的股权，债权人仍然可以通过其他方式维护自己的权益。例如，债权人可以申请冻结被质押股权所代表的公司的银行账户。这种方式可以防止被质押股权转让所带来的可能损害。

此外，在特定情况下，债权人还可以起诉质权人和债务人之间存在的违约行为，并要求法院采取相应措施以保护其利益。这可能包括解除质押合同、追究违约责任等。

需要注意的是，股权质押是一种特定的合同关系，其中规定了各方的权利义务。对于债务人而言，及时履行还款义务将避免可能出现的法律风险。对于质权人而言，做好尽职调查和谨慎选择合作对象，可以减少后续风险。

综上所述，尽管法院不能直接冻结被质押的股权，但债权人仍然有多种方式来保护自己的利益。在进行股权质押交易时，债权人和债务人双方都应明确各自的权利和义务，并遵守相关法律法规，以避免发生不必要的纠纷。