法院查封车，扣车费谁负责？这是一个常见的问题，涉及汽车所有权、行政执法和司法程序等多个方面。在我国，法律规定了一系列相关的规则和程序来解决该问题。

首先，根据我国《中华人民共和国物权法》的规定，车辆所有权登记在案的，享有车辆的所有权。这意味着在车辆所有权归属确定前，无权处分车辆。因此，如果车辆已经被查封，即使暂时交给他人保管，所有权依然归原车主所有。只有在法院判决生效后，车辆所有权的变更才会发生。

其次，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，公安机关在侦查、抓捕嫌疑人或者执行刑罚过程中，可以对犯罪嫌疑人的车辆进行查封。这种情况下，查封车辆的费用由公安机关承担。公安机关需要出具相应的证明文件，说明车辆被查封的原因和期限，并支付相应的费用。

然而，如果车辆被行政执法部门查封，比如交警因交通违法对车辆进行扣留，情况就有所不同了。根据《中华人民共和国行政处罚法》的规定，如果车辆所有人在规定期限内未支付违法罚款，交警有权扣押车辆并采取查封措施。

关于这种情况下的费用负担问题，在《中华人民共和国行政诉讼法》中也有明确规定。该法规定，对于因违法行为而被查封扣留的车辆，其所有人应当支付相应的保管、鉴定、扣车费用等。如果所有人拒不支付费用，行政机关可以依法将车辆予以变卖，并优先从变卖所得中偿付费用。

综上所述，在法院查封车辆的情况下，车辆所有权归原车主所有，车辆的查封费用由公安机关承担；而在行政执法部门扣留车辆的情况下，车辆所有权仍然归原车主所有，但扣车费用则由车主自行承担。如果车主拒不支付费用，行政机关可以将车辆变卖来弥补费用。

需要说明的是，这些规定只是对一般情况下的处理方式做了规定，实际情况还需根据具体案件进行判断。当然，在涉及车辆所有权和扣车费用问题时，最好咨询专业律师，以确定合适的解决方法。