法院冻结是指法院根据被执行人的申请或者自己裁定，采取一系列措施限制被执行人的资金、财产等活动。其中一种常见的冻结方式就是通过银行进行冻结。

从法律层面上来说，法院对被执行人的银行账户进行冻结是合法的。根据我国《民事诉讼法》第259条规定，法院可以冻结被执行人存款账户或者其他形式财产，但需要提前通知相关银行或机构进行冻结操作。

在实际操作中，当法院冻结被执行人的银行账户时，一般会向相关银行发出冻结通知书，要求对账户内的金额进行冻结。银行接到通知后，会依法执行，将被执行人账户内的资金暂时冻结，以保护债权人的权益。

被执行人的账户冻结并不意味着所有资金都无法使用。根据我国《民事诉讼法》的规定，法院在冻结账户时，会为被执行人留出必要的生活费用，并可以根据个案具体情况解冻部分或全部冻结金额。

同时，被执行人也有权利提起异议，并向法院提供相关证据和理由，要求解除账户冻结。法院会根据情况对异议进行审查，如果认为异议成立，可以解除或者减轻冻结限制。

然而，需要注意的是，法院冻结操作只能针对通过银行体系流通的资金和财产，无法冻结现金、实物等其他形式的财产。因此，如果被执行人将其财产转化为非银行渠道或采取其他措施进行避让，可能会给后续的执行工作带来一定困难。

总之，法院冻结被执行人的银行账户是合法有效的措施，旨在保障债权人的合法权益。被执行人应当积极配合并依法履行相应义务，遵守法院的冻结决定。对于异议情况，可以提出相关申请，寻求解决方案。