法院是否有权冻结公民的低保金是一个备受争议的话题。低保制度是我国社会保障体系中的重要组成部分，旨在解决生活困难人员的基本生活问题。然而，在一些特殊情况下，例如涉及刑事案件或债务纠纷等，法院可能会采取冻结低保金的措施。

首先，我们需要了解低保制度的性质。低保金并非个人的绝对财产所有权，而是由国家提供的一项社会救助，属于公共资金。因此，在特殊情况下，法院有权根据法律规定对其进行限制或冻结。

其次，冻结低保金有其特殊性和合理性。在刑事案件中，当被告涉嫌犯罪，且存在销赃、藏匿赃款的可能时，冻结其低保金可以有效防止其逃避追究责任。同样，在债务纠纷中，当债务人存在潜逃风险、拒不履行义务等情况时，冻结低保金也是一种手段，以保护债权人的合法权益。

然而，冻结低保金也需要符合相关法律程序和原则。首先，法院应当有合法的理由和依据，不能滥用职权。其次，必须经过合法的审判程序，以确保被冻结的低保金所属人享有诉讼权利和申辩权。

此外，法院在冻结低保金的同时，也应当考虑被冻结低保金所属人的生活困境和基本生存需求。如果对方已经处于生活困境，冻结低保金可能导致其无法基本生活，那么法院应当在决定冻结低保金时予以慎重考虑，并斟酌其他措施来保证双方权益平衡。

综上所述，法院在特殊情况下有权冻结公民的低保金，但应当遵循法律程序和原则，充分保护各方权益。在实际操作中，法院应当权衡各种因素，综合考虑公共利益与个人生存需求，做出合理而公正的决定。