在一些特定情况下，法院可以对房屋进行查封并将其出售。然而，这种操作并不总是合法的。

法院查封房屋出售是一种强制手段，用于执行法院作出的判决或者解决债务纠纷。一般情况下，法院只会在当事人无法履行法律义务或拒不接受法院决定时才会采取这一措施。

然而，即使是在这种情况下，法院也必须严格遵守相关法律程序。他们需要依法办理查封手续，并向被查封的房屋所有人或持有人发出公告通知。被查封后的房屋通常会被委托给拍卖公司进行出售，以偿还相关债务。

然而，如果法院在查封和出售房屋的过程中违反了相关法律规定，那么这样的操作就是违法的。例如，在未经法律程序的情况下擅自查封房屋，或者没有妥善通知房屋所有人，都可能构成违法行为。

此外，法院在查封房屋时也应当尊重当事人的合法权益。他们在决定查封前应该充分考虑被查封房屋所有人和持有人的生活需要，确保他们有足够的住所可供居住。

因此，不论是法院还是拍卖公司，在执行查封和出售房屋的程序时都应严格遵守相关法律规定。同时，被查封房屋所有人也有权利进行抗辩，并通过合法途径维护自己的合法权益。

总之，法院查封房屋并出售有一定的合法性，但必须在合法程序下进行。如果违反相关法律规定，这样的操作将被认为是非法的，并可能给当事人带来不必要的损失。