工程保函，是一种由担保人（通常为银行或保险公司）向受保人（通常为业主或总承包商）开具的书面担保文件，保证承包商履行合同义务。工程保函在工程建设领域中发挥着重要的作用，为受保人提供风险保障，确保工程顺利实施。当承包商未能履行合同义务时，受保人可以向担保人索赔，由担保人按照保函条款向受保人支付赔偿金。

工程保函的付款方式通常取决于保函的类型和合同的具体约定。常见的工程保函付款方式有以下几种：

1. 按需付款保函

按需付款保函是一种无条件的保函，只要受保人向担保人提出书面索赔，并且提供相关证据证明承包商未履行合同义务，担保人就必须向受保人支付赔偿金。这种保函的付款程序相对简单，受保人不需要经过复杂的仲裁或诉讼程序，即可获得赔偿。但是，由于担保人承担的风险较高，按需付款保函的保费通常也比较高。

2. 跟单付款保函

跟单付款保函是一种有条件的保函，受保人只有在提供符合保函规定的单据时，担保人才会向受保人支付赔偿金。通常情况下，受保人需要提供合同、发票、工程进度报告等单据，证明承包商已经完成了合同中约定的工作量。跟单付款保函的付款程序相对复杂，但由于担保人承担的风险较低，保费也相对较低。

3. 预付款保函

预付款保函是在工程开工前，由业主开给承包商的保函。如果承包商在收到预付款后不开始施工或不按合同约定执行工程，业主可以向担保人索赔，由担保人向业主支付赔偿金。预付款保函可以保障业主在支付预付款后，承包商能够按照合同约定履约。但是，由于预付款保函担保的金额较小，如果承包商大量违约，保函的赔偿范围可能不够。

4. 履约保函

履约保函是在工程结束后，由承包商开给业主的保函。如果承包商在工程保修期内出现质量问题，业主可以向担保人索赔，由担保人向业主支付赔偿金。履约保函可以保障业主在工程竣工后，承包商能够对工程质量进行保修。但是，由于履约保函担保的期限较长，保费也相对较高。

5. 投标保函

投标保函是在招投标阶段，由投标人开给招标人的保函。如果投标人中标后不与招标人签订合同，招标人可以向担保人索赔，由担保人向招标人支付赔偿金。投标保函可以保障招标人招到具有诚意和能力的承包商。但是，由于投标保函担保的金额较小，如果投标人中标后大量违约，保函的赔偿范围可能不够。

在工程保函的付款实践中，通常由受保人根据合同约定向担保人提出索赔申请。担保人收到索赔申请后，会对受保人提交的单据进行审核。如果担保人认为受保人符合保函条款，则会向受保人支付赔偿金。赔偿金的金额一般以合同中约定的金额为准，但不得超过保函的担保金额。

工程保函的付款方式选择应根据工程项目的具体情况和风险程度综合考虑。业主和承包商在签订工程合同时，应明确约定工程保函的类型、金额、付款方式等事项。合理选择工程保函的付款方式，可以有效保障工程项目的顺利实施，维护业主和承包商的合法权益。